В 2002-2008 годах Фетисов возглавлял сначала Федеральное агентство, а затем пришедший ему на смену Государственный комитет по физической культуре и спорту. В 2016 году он стал депутатом Государственной думы, где занимает должность зампреда комитета по физической культуре, спорту, туризму и делам молодежи